Símbolo da união das entidades da cadeia produtiva do algodão de Goiás, a Casa do Algodão tem como função fortalecer a integração das instituições para, em parceria, realizarem todas as ações referentes ao setor e estreitar o relacionamento com as instituições públicas e privadas ligadas à cotonicultura.

Fundada em 2005, a Casa do Algodão é a sede da Associação Goiana dos Produtores de Algodão (AGOPA) e do Fundo de Incentivo à Cultura do Algodão (FIALGO). Nela se encontra o escritório, em Goiânia, do Instituto Goiano de Agricultura (IGA), da Associação dos Produtores de Soja e Milho de Goiás (APROSOJA-GO) e o Laboratório de Classificação Visual e Tecnológica da Fibra de Algodão da Agopa. Também é o ponto de apoio do produtor de algodão na capital goiana.